Сравнительный анализ профиля кишечной микробиоты матерей и новорожденных при преждевременных и своевременных родах
Цель: Изучить профиль кишечной микробиоты (КМ) родильниц и новорожденных с использованием метода высокопроизводительного секвенирования (NGS) при преждевременных и своевременных родах.Горина К.А., Ходжаева З.С., Шубина Е., Рогачева М.С., Муминова К.Т., Припутневич Т.В.
Материалы и методы: Проведено проспективное исследование с участием 30 пар мать-новорожденный. Родильницы и новорожденные были разделены на две группы в зависимости от сроков родоразрешения: I группу составили 15 пар мать-новорожденный со спонтанными преждевременными родами (сПР), срок родов составил 32,8 (2,08) недель, II группу – 15 пар мать-новорожденный со своевременными родами (СР), наступившими в 39,5 (0,98) недель. Изучение видового состава КМ проведено методом NGS.
Результаты: Меконий новорожденных обеих групп не был стерильным, доминирующими микроорганизмами были Acinetobacter и Cutibacterium (семейство Propionibacteriaceae). Ведущими представителями КМ обеих групп родильниц были микроорганизмы рода Bifidobacterium (тип Actinobacteria). Сравнительный анализ профиля КМ матерей и новорожденных обеих групп не выявил статистически значимых различий (p>0,05).
Заключение: Нестерильность мекония, его антенатальная колонизация посредством материнско-плодовой трансмиссии с формированием уникальной микробиоты, должна расцениваться, как новый важный фактор перинатального программирования.
Ключевые слова
кишечная микробиота
пренатальный микробиом
высокопроизводительное секвенирование
преждевременные роды
недоношенные новорожденные
Список литературы
- Dunlop A.L., Mulle J.G., Ferranti E.P., Edwards S., Dunn A.B., Corwin E.J. Maternal microbiome and pregnancy outcomes that impact infant health: a review. Adv. Neonatal Care. 2015; 15(6): 377-85. https://dx.doi.org/10.1097/ANC.0000000000000218.
- Воронцова З.А., Никитюк Д.Б., Кудаева Э.Ф. Кишечно-ассоциированная лимфоидная ткань как информационно-корректирующая система экстремальных состояний (краткий обзор литературы). Вестник новых медицинских технологий. 2016; 4: 289-94.
- Dahl C., Stanislawski M., Iszatt N., Mandal S. Gut microbiome of mothers delivering prematurely shows reduced diversity and lower relative abundance of Bifidobacterium and Streptococcus. Abdo Z, editor. PLoS One. 2017; 12(10): e0184336. https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0184336.
- Gibson M.K., Crofts T.S., Dantas G. Antibiotics and the developing infant gut microbiota and resistome. Curr. Opin. Microbiol. 2015; 27: 51-6. https://dx.doi.org/10.1016/j.mib.2015.07.007.
- Walker R.W., Clemente J.C., Peter I., Loos R.J.F. The prenatal gut microbiome: are we colonized with bacteria in utero? Pediatr. Obes. 2017; 12(Suppl. 1): 3-17. https://dx.doi.org/10.1111/ijpo.12217.
- Koleva P.T., Kim J.-S., Scott J.A., Kozyrskyj A.L. Microbial programming of health and disease starts during fetal life. Birth Defects Res. C Embryo Today. 2015; 105(4): 265-77. https://dx.doi.org/10.1002/bdrc.21117.
- Funkhouser L.J., Bordenstein S.R. Mom knows best: the universality of maternal microbial transmission. PLoS Biol. 2013; 11(8): e1001631. https://dx.doi.org/10.1371/journal.pbio.1001631.
- Lagier J.-C., Armougom F., Million M., Hugon P., Pagnier I., Robert C. et al. Microbial culturomics: paradigm shift in the human gut microbiome study. Clin. Microbiol. Infect. 2012; 18(12): 1185-93. https://dx.doi.org/10.1111/1469-0691.12023.
- Moreira D., López-García P. Phylotype. In: Encyclopedia of astrobiology. Berlin, Heidelberg: Springer; 2011: 1254. https://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-11274-4_1210.
- Johnson J.S., Spakowicz D.J., Hong B.-Y., Petersen L.M., Demkowicz P., Chen L. et al. Evaluation of 16S rRNA gene sequencing for species and strain-level microbiome analysis. Nat. Commun. 2019; 10(1): 5029. https://dx.doi.org/10.1038/s41467-019-13036-1.
- Malla M.A., Dubey A., Kumar A., Yadav S., Hashem A., Abd Allah E.F. Exploring the human microbiome: the potential future role of next-generation sequencing in disease diagnosis and treatment. Front. Immunol. 2019; 9: 2868. https://dx.doi.org/10.3389/fimmu.2018.02868.
- Алексеева А.Е., Бруснигина Н.Ф. Возможности и перспективы применения методов массивного параллельного секвенирования в диагностике и эпидемиологическом надзоре за инфекционными заболеваниями. МедиАль. 2014; 12(2): 6-28.
- Cole J.R., Wang Q., Fish J.A., Chai B., McGarrell D.M., Sun Y. et al. Ribosomal database project: data and tools for high throughput rRNA analysis. Nucleic Acids Res. 2014; 42(Database issue): D633-42. https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkt1244.
- Quast C., Pruesse E., Yilmaz P., Gerken J., Schweer T., Yarza P. et al. The SILVA ribosomal RNA gene database project: improved data processing and web-based tools. Nucleic Acids Res. 2013; 41(Database issue): D590-6. https://dx.doi.org/10.1093/nar/gks1219.
- Solt I. The human microbiome and the great obstetrical syndromes: a new frontier in maternal-fetal medicine. Best Pract. Res. Clin. Obstet. Gynaecol. 2015; 29(2): 165-75. https://dx.doi.org/10.1016/j.bpobgyn.2014.04.024.
- Batt C.A., Tortorello M.L., eds. Encyclopedia of food microbiology. 2nd ed. 2014: 216-22.
- Zarrilli R., Bagattini M., Esposito E.P., Triassi M. Acinetobacter infections in neonates. Curr. Infect. Dis. Rep. 2018; 20(12): 48. https://dx.doi.org/10.1007/s11908-018-0654-5.
- Hiltunen H., Collado M.C., Ollila H., Kolari T., Tölkkö S., Isolauri E. et al. Spontaneous preterm delivery is reflected in both early neonatal and maternal gut microbiota. Pediatr Res. 2021 Aug 4. https://dx.doi.org/10.1038/s41390-021-01663-8. Online ahead of print.
- Горина К.А., Ходжаева З.С., Муравьева В.В., Муминова К.Т., Донников А.Е., Припутневич Т.В. Роль микробиоты кишечника матери при спонтанных преждевременных родах. Акушерство и гинекология. 2020; 8: 64-71.
- Integrative HMP (iHMP) Research Network Consortium. The integrative human microbiome project. Nature. 2019; 569(7758): 641-8. https://dx.doi.org/10.1038/s41586-019-1238-8.
- Romano-Keeler J., Weitkamp J.-H. Maternal influences on fetal microbial colonization and immune development. Pediatr. Res. 2015; 77(1-2): 189-95. https://dx.doi.org/10.1038/pr.2014.163.
- Hu J., Nomura Y., Bashir A., Fernandez-Hernandez H., Itzkowitz S., Pei Z. et al. Diversified microbiota of meconium is affected by maternal diabetes status. PLoS One. 2013; 8(11): e78257. https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0078257.
Поступила 01.09.2021
Принята в печать 09.11.2021
Об авторах / Для корреспонденции
Горина Ксения Алексеевна, м.н.с. 1 отделения акушерского патологии беременности, Национальный медицинский исследовательский центр акушерства, гинекологии, перинатологии им. академика В.И. Кулакова Министерства здравоохранения Российской Федерации, +7(926)649-77-32, k_gorina@oparina4.ru,https://orcid.org/0000-0001-6266-2067, 117997, Россия, Москва, ул. Академика Опарина, д. 4.
Ходжаева Зульфия Сагдуллаевна, д.м.н., профессор, заместитель директора по научной работе Института акушерства, Национальный медицинский исследовательский центр акушерства, гинекологии, перинатологии имени академика В.И. Кулакова Министерства здравоохранения Российской Федерации,
+7(916)407-75-67, zkhodjaeva@mail.ru, https://orcid.org/0000-0001-8159-3714, 117997, Россия, Москва, ул. Академика Опарина, д. 4.
Шубина Екатерина, заведующая лабораторией анализа геномных данных, Национальный медицинский исследовательский центр акушерства, гинекологии, перинатологии имени академика В.И. Кулакова Министерства здравоохранения Российской Федерации, +7(495)531-44-44, e_shubina@oparina4.ru,
https://orcid.org/0000-0003-4383-7428, 117997, Россия, Москва, ул. Академика Опарина, д. 4.
Рогачева Маргарита Сергеевна, м.н.с. лаборатории анализа геномных данных, Национальный медицинский исследовательский центр акушерства, гинекологии, перинатологии имени академика В.И. Кулакова Министерства здравоохранения Российской Федерации, +7(953)370-85-12, m_rogacheva@oparina4.ru,
https://orcid.org/0000-0002-2495-2554, 117997, Россия, Москва, ул. Академика Опарина, д. 4.
Муминова Камилла Тимуровна, к.м.н., м.н.с. 1 отделения акушерского патологии беременности, Национальный медицинский исследовательский центр акушерства, гинекологии, перинатологии имени академика В.И. Кулакова Министерства здравоохранения Российской Федерации, +7(916)373-77-07, k_muminova@oparina4.ru,
https://orcid.org/0000-0003-2708-4366, 117997, Россия, Москва, ул. Академика Опарина, д. 4.
Куцарь Елена Ивановна, клинический ординатор, Национальный медицинский исследовательский центр акушерства, гинекологии, перинатологии
имени академика В.И. Кулакова Министерства здравоохранения Российской Федерации, +7(916)766-98-99, kutsar.elena@mail.ru, https://orcid.org/0000-0002-6974-7773,
117997, Россия, Москва, ул. Академика Опарина, д. 4.
Припутневич Татьяна Валерьевна, д.м.н., заведующая отделом микробиологии, клинической фармакологии и эпидемиологии, Национальный медицинский исследовательский центр акушерства, гинекологии, перинатологии имени академика В.И. Кулакова Министерства здравоохранения Российской Федерации,
+7(903)264-12-57, priputl@gmail.com, https://orcid.org/0000-0002-4126-9730, 117997, Россия, Москва, ул. Академика Опарина, д. 4.
Вклад авторов: Горина К.А., Ходжаева З.С., Шубина Е., Рогачева М.С., Муминова К.Т., Куцарь Е.И., Припутневич Т.В. – разработка дизайна исследования, получение данных для анализа, обзор публикаций по теме статьи, их перевод, редактирование; Горина К.А., Ходжаева З.С. – написание текста рукописи; Рогачева М.С.,
Горина К.А. – статистический анализ полученных данных.
Конфликт интересов: Авторы заявляют об отсутствии возможных конфликтов интересов.
Финансирование: Исследование выполнено при финансовой поддержке РФФИ в рамках научного проекта
№ 19-315-90104.
Согласие пациентов на публикацию: Матери новорожденных подписали информированное согласие на публикацию своих данных.
Обмен исследовательскими данными: Данные, подтверждающие выводы этого исследования, доступны по запросу
у автора, ответственного за переписку, после одобрения ведущим исследователем.
Для цитирования: Горина К.А., Ходжаева З.С., Шубина Е., Рогачева М.С., Муминова К.Т., Куцарь Е.В., Припутневич Т.В. Сравнительный анализ профиля кишечной микробиоты матерей и новорожденных при преждевременных и своевременных родах.
Акушерство и гинекология. 2021; 12: 88-95
https://dx.doi.org/10.18565/aig.2021.12.88-95
Также по теме
