Риск-ориентированный анализ диагностических панелей для скрининга носителей моногенных заболеваний
На территории Российской Федерации существует ряд аутосомно-рецессивных болезней с достаточно высокой частотой заболеваемости, для которых известны генетические маркеры. Диагностическая эффективность скрининговых панелей традиционно базируется на данных о распространенности определяемых мутаций, что достаточно сложно определить в гетерогенныхЗобкова Г.Ю., Донников А.Е., Прытков А.Н., Демикова Н.С., Рагимов А.А.
популяциях.
Цель: Оценить эффективность скрининговой панели на носительство мутаций гена CFTR в Российской Федерации с помощью риск-ориентированного подхода.
Материалы и методы: Материалом исследования послужили образцы периферической крови 1000 здоровых доноров. Молекулярно-генетическое исследование образцов проводили методом анализа 24 наиболее частых мутаций в гене CFTR с методом ПЦР в режиме реального времени с анализом кривых плавления.
Результаты: В ходе исследования было обнаружено 29 носителей мутаций из 1000 здоровых индивидов. Суммарная распространенность определяемых мутаций составила 2,9%. Уязвимость используемой панели с 95% вероятностью составляет не более, чем 31%, что достаточно близко к значению уязвимости, теоретически рассчитанной исходя из распространенности включенных мутаций (24,5). При использовании указанной панели на носительства мутаций в гене CFTR у обоих партнеров риск рождения больного ребенка будет составлять всего 1/170068, что в 17 раз ниже общепопуляционного риска.
Заключение: При использовании указанной панели у обоих партнеров можно снизить риск рождения больного ребенка в 17 раз, по сравнению с общепопуляционным. Использование риск-ориентированного подхода позволило эффективно оценить уязвимость используемой панели. Данная методика применима для любой гетерогенной популяции, если известна заболеваемость, том числе и для населения России.
Ключевые слова
наследственные заболевания
преконцепционный генетический скрининг
муковисцидоз
генетический риск
скрининг носителей
менеджмент рисков
Список литературы
- Gregg A.R. Expanded carrier screening. Obstet. Gynecol. Clin. North Am. 2018; 45(1): 103-12. https://dx.doi.org/10.1016/j.ogc.2017.10.005.
- Scott S.A., Edelmann L. Experience with carrier screening and prenatal diagnosis for 16 Ashkenazi Jewish genetic diseases. Hum. Mutat. 2010; 31(11): 1240-50. https://dx.doi.org/ 10.1002/humu.21327.
- ГОСТ Р 51897-2011/Руководство ИСО 73:2009 Национальный стандарт Российской Федерации. Менеджмент риска. Термины и определения.
- Капранов Н.И., Каширская Н.Ю., ред. Муковисцидоз. M.: Медпрактика-М; 2014. 672 с.
- Воронкова А.Ю., Амелина Е.Л., Каширская Н.Ю., Кондратьева Е.И., Красовский С.А., Старинова М.А., Капранов Н.И., ред. Регистр больных муковисцидозом в Российской Федерации. 2017 год. М.: Медпрактика-М; 2019. 68 с.
- Kerem B., Rommens J.M., Buchanan J.A., Markiewicz D., Cox T.K., Chakravarti A. et al. Identification of the cystic fibrosis gene: genetic analysis. Science. 1989; 245(4922): 1073-80. https://dx.doi.org/10.1126/science.2570460.
- Watson M.S., Cutting G.R., Desnick R.J., Driscoll D.A., Klinger K., Mennuti M. et al. Cystic fibrosis population carrier screening: 2004 revision of American College of Medical Genetics mutation panel. Genet. Med. 2004; 6(5): 387-91. https://dx.doi.org/ 10.1097/01.gim.0000139506.11694.7c.
- American College of Obstetricians and Gynecologists Committee on Genetics. ACOG Committee Opinion No. 486: Update on carrier screening for cystic fibrosis. Obstet. Gynecol. 2011; 117(4): 1028-31. https://dx.doi.org/10.1097/AOG.0b013e31821922c2.
- Castellani C., Macek M. Jr, Cassiman J.J., Duff A., Massie J., ten Kate L.P. et al. Benchmarks for cystic fibrosis carrier screening: a European consensus document. J. Cyst. Fibros. 2010; 9(3): 165-78. https://dx.doi.org/10.1016/j.jcf.2010.02.005.
- Zlotogora J. Population programs for the detection of couples at risk for severe monogenic genetic diseases. Hum. Genet. 2009; 126(2): 247-53. https://dx.doi.org/10.1007/s00439-009-0669-y.
- Massie J., Petrou V., Forbes R., Curnow L., Ioannou L., Dusart D. et al. Population-based carrier screening for cystic fibrosis in Victoria: the first three years experience. Aust. N. Z. J. Obstet. Gynaecol. 2009; 49(5): 484-9. https://dx.doi.org/10.1111/j.1479-828X.2009.01045.x.
- Castellani C., Picci L., Tamanini A., Girardi P., Rizzotti P., Assael B.M. Association between carrier screening and incidence of cystic fibrosis. JAMA. 2009; 302(23): 2573-9. https://dx.doi.org/10.1001/jama.2009.1758.
- Cunningham S., Marshall T. Influence of five years of antenatal screening on the paediatric cystic fibrosis population in one region. Arch. Dis. Child. 1998; 78: 345-8.
- Witt D., Wold C., Goonewardena P., Louie E., Rosenfeld S. Cystic fibrosis prenatal screening of 103,600 individuals in an HMO: molecular/clinical outcomes and a dramatic reduction in CF incidence. Proceedings of Annual Meeting, American Society of Human Genetics. Philadelphia, PA, USA; Nov 11-15, 2008. 686 (abstr.).
- Министерство здравоохранения и социального развития Российской Федерации. Приказ от 22.03.2006 № 185 «О массовом обследовании новорожденных детей на наследственные заболевания».
- Шерман В.Д., Каширская Н.Ю., Капранов Н.И. Современный алгоритм диагностики муковисцидоза. Педиатрия. Журнал им. Г.Н. Сперанского. 2014; 93(4): 68-74.
- Баранов А.А., Капранов Н.И., Каширская Н.Ю., Намазова-Баранова Л.С., Шерман В.Д., Симонова О.И., Томилова А.Ю., Савостьянов К.В., Пушков А.А., Владыкин А.Л., Шатохин Н.В. Проблемы диагностики муковисцидоза и пути их решения в России. Педиатрическая фармакология. 2014; 11(6): 16-23.
- Dodge J.A. A millennial view of cystic fibrosis. Dev. Period. Med. 2015; 19 (1): 9-13.
- Степанова А.А., Красовский С.А., Поляков А.В. Информативность поиска 19 частых мутаций в гене CFTR у российских больных муковисцидозом и расчетная частота заболевания в Российской Федерации. Генетика. 2016; 52(2): 231-41.
- Симакова Т.С., Брагин А.Г., Глушкова М.А., Петрова Н.В., Поляков А.В., Кондратьева Е.И., Шерман В.Д., Павлов А.Е. Опыт применения таргетного секвенирования для молекулярной диагностики муковисцидоза. Клиническая лабораторная диагностика. 2017; 62(5): 305-9.
- Литвинова М.М., Дадали Е.Л., Шевченко К.Г., Поляков А.В., Исаев А.А. Результаты генетического скрининга новорожденных на наличие наиболее частых наследственных заболеваний с аутосомно-рецессивным типом наследования. Клеточная трансплантология и тканевая инженерия. 2013; 8(3): 39-40.
- Гржибовский А.М., Иванов С.В., Горбатова М.А. Анализ номинальных и ранговых переменных данных с использованием программного обеспечения Statistica и SPSS. Наука и здравоохранение. 2016; 6. 5-39.
Поступила 10.03.2022
Принята в печать 24.03.2022
Об авторах / Для корреспонденции
Зобкова Гаухар Юрьевна, аспирант кафедры медицинской генетики, РМАНПО Минздрава России, zobkova.dna@gmail.com, https://orcid.org/0000-0002-9624-0484, ResearcherID: W-8153-2019, 119049, Россия, Москва, пер. 4-й Добрынинский, д. 1/9.Донников Андрей Евгеньевич, к.м.н., заведующий лабораторией молекулярно-генетических методов, НМИЦ АГП им. акад. В.И. Кулакова Минздрава России,
a_donnikov@oparina4.ru, https://orcid.org/0000-0003-3504-2406, ReasearcherID: E-7178-2015, ScopusID: 6505485697,
117997, Россия. Москва, ул. Академика Опарина, д. 4.
Прытков Александр Николаевич, к.м.н., доцент, с.н.с. кафедры медицинской генетики, РМАНПО Минздрава России,
119049, Россия, Москва, пер. 4-й Добрынинский, д. 1/9.
Демикова Наталия Сергеевна, д.м.н., профессор, заведующая кафедрой медицинской генетики, РМАНПО Минздрава России,
119049, Россия, Москва, пер. 4-й Добрынинский, д. 1/9.
Рагимов Алигейдар Агаалекпер, д.м.н., профессор кафедры реаниматологии и анестезиологии, Первый МГМУ им. И.М. Сеченова Минздрава России
(Сеченовский Университет), ra50@mail.ru, 119991, Россия, Москва, ул. Большая Пироговская, д. 2, стр. 4.
Вклад авторов: Зобкова Г.Ю. – сбор и анализ материала, статистическая обработка данных, написание текста; Донников А.Е. – концепция и дизайн исследования, статистическая обработка данных; Прытков А.Н. – статистическая обработка данных, редактирование; Демикова Н.С. – концепция и дизайн исследования, редактирование; Рагимов А.А. – сбор биологического материала.
Конфликт интересов: Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.
Финансирование: работа выполнена в рамках разработки и валидации набора реагентов для выявления мутаций, ассоциированных с муковисцидозом, фенилкетонурией, галактоземией и нейросенсорной несиндромальной тугоухостью методом ПЦР в режиме реального времени (МоногенСкрин).
Одобрение Этического комитета: Исследование было одобрено Этическим комитетом ФГБУ ГНЦ Институт иммунологии ФМБА России (протокол № 8 от 5 сентября 2012 г.).
Обмен исследовательскими данными: Данные, подтверждающие выводы этого исследования, доступны по запросу у автора, ответственного за переписку, после одобрения ведущим исследователем.
Для цитирования: Зобкова Г.Ю., Донников А.Е., Прытков А.Н.,
Демикова Н.С., Рагимов А.А. Риск-ориентированный анализ диагностических панелей
для скрининга носителей моногенных заболеваний.
Акушерство и гинекология. 2022; 4: 148-154
https://dx.doi.org/10.18565/aig.2022.4.148-154
